67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0200 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  99.89 
 
 		 881 aa  1738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  94.78 
 
 		 881 aa  1684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 882 aa  1790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  99.77 
 
 		 882 aa  1788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.81 
 
 		 814 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.28 
 
 		 681 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.28 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  36.08 
 
 		 715 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  34.91 
 
 		 1160 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.46 
 
 		 802 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.91 
 
 		 803 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.73 
 
 		 801 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.75 
 
 		 800 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.79 
 
 		 808 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.79 
 
 		 808 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.24 
 
 		 761 aa  323  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.77 
 
 		 833 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.16 
 
 		 860 aa  320  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.81 
 
 		 858 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.43 
 
 		 838 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.29 
 
 		 858 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.29 
 
 		 858 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.42 
 
 		 837 aa  311  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.71 
 
 		 840 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.32 
 
 		 841 aa  302  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  31.4 
 
 		 847 aa  299  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.5 
 
 		 838 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.07 
 
 		 820 aa  296  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.72 
 
 		 821 aa  295  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32 
 
 		 777 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.6 
 
 		 817 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.31 
 
 		 803 aa  284  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  31.02 
 
 		 835 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.11 
 
 		 798 aa  275  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  30.75 
 
 		 786 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.75 
 
 		 786 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 1505 aa  266  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.06 
 
 		 1132 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.72 
 
 		 1592 aa  264  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.14 
 
 		 433 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.68 
 
 		 430 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  54.17 
 
 		 596 aa  104  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  48.39 
 
 		 722 aa  92.8  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  45.26 
 
 		 679 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  48.96 
 
 		 589 aa  88.6  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  55.13 
 
 		 722 aa  88.2  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  46.88 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  45.56 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 742 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  45.45 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  37.78 
 
 		 661 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  35.58 
 
 		 605 aa  65.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  36.04 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  35.8 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  30.86 
 
 		 623 aa  55.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  52  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  52  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  28.57 
 
 		 563 aa  51.6  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  30.43 
 
 		 644 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  29.52 
 
 		 741 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  40.32 
 
 		 555 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2137  glycoside hydrolase starch-binding  30.69 
 
 		 752 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  24.09 
 
 		 610 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  36.25 
 
 		 614 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  23.58 
 
 		 673 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>