101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0148 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  99.44 
 
 
356 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  91.01 
 
 
356 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  99.72 
 
 
356 aa  703    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  100 
 
 
356 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  70.28 
 
 
354 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  69.66 
 
 
352 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  43.84 
 
 
365 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  44.22 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  40.11 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  43.06 
 
 
360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  43.18 
 
 
347 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  41.81 
 
 
372 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  42.94 
 
 
349 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  43.06 
 
 
351 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  38.44 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  43.06 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  42.77 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  42.57 
 
 
367 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  42.57 
 
 
367 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  42.57 
 
 
367 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  42.57 
 
 
345 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  39.07 
 
 
372 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  36.75 
 
 
397 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  36.75 
 
 
397 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  42.57 
 
 
367 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  36.87 
 
 
393 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  42.77 
 
 
371 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  39.66 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  27.49 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  27.38 
 
 
346 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.32 
 
 
345 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.4 
 
 
345 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.82 
 
 
343 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  28.99 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.75 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.69 
 
 
339 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  40.8 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  40.8 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  40.8 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  40.8 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  40.8 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  40.8 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  40.8 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  40.8 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  36.94 
 
 
342 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  27.83 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  44 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  26.96 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  26.35 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  27.61 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  28.32 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  28.41 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  28.41 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  28.41 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  28.41 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  28.41 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  28.65 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  28.65 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.92 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.2 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.92 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.14 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  26.54 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.38 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  26.22 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  27.12 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  36.36 
 
 
523 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  38.32 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  30.48 
 
 
522 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  30.82 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  31.62 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  31.62 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  24.25 
 
 
371 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  34.41 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  34.41 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  34.41 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  34.41 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  34.41 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  34.41 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.37 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.1 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  32.11 
 
 
524 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  31.1 
 
 
373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  31.1 
 
 
373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  31.73 
 
 
533 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  34.17 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  31.73 
 
 
533 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  31.73 
 
 
533 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  25.51 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  29.81 
 
 
534 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  36.27 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  32.23 
 
 
530 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  32.11 
 
 
789 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  32.11 
 
 
790 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  32.41 
 
 
527 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  26.67 
 
 
467 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  23.42 
 
 
469 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  26.67 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>