More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0088 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0088  AraC family transcription regulator  100 
 
 		 170 aa  333  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0092  AraC family transcriptional regulator  95.88 
 
 		 168 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1236  AraC family transcriptional regulator  95.88 
 
 		 168 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1518  AraC family transcriptional regulator  95.88 
 
 		 168 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0077  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 168 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  97.65 
 
 		 205 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  97.06 
 
 		 170 aa  300  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 360 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 357 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 360 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 360 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 356 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 356 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 336 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 336 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 347 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 355 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 347 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 345 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 345 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 366 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 357 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 341 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 347 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 340 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 366 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  34.84 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 398 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 345 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 340 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 342 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.5 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1709  Fis family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.839551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  30.41 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  32.34 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  36.62 
 
 		 342 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 337 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 389 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0713  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 344 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 385 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  41.41 
 
 		 330 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 364 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 398 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.85 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2928  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3972  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>