More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0059 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  99.33 
 
 		 451 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  99.56 
 
 		 451 aa  876    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  99.33 
 
 		 451 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  99.33 
 
 		 451 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 451 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 451 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  94.69 
 
 		 452 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  99.33 
 
 		 451 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  64.06 
 
 		 451 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  60.68 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  56.86 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  51.84 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  51.61 
 
 		 448 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  53.23 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  59.28 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  53.07 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  53.04 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  55.53 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  52.34 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  53.69 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 452 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  54.85 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  55.83 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  49.77 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  54.42 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  56.08 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  50.11 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  51.25 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  48.2 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  56.61 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  49.19 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  51.15 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  52.57 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  49.53 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  50.46 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 448 aa  362  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  47.43 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.29 
 
 		 465 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 452 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  43.65 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  53.88 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  51.88 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  44.88 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  44.88 
 
 		 452 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  44.88 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  44.88 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.99 
 
 		 452 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  45.22 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  49.67 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  44.42 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  38.56 
 
 		 475 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  40.59 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  39.42 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  39.42 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  41.11 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.25 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  39.42 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  39.42 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  39.42 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  39.42 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  39.42 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 454 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>