More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0038 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  100 
 
 
155 aa  312  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  99.35 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  99.35 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  99.35 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  99.35 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  98.71 
 
 
155 aa  308  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  98.06 
 
 
155 aa  306  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  77.63 
 
 
155 aa  246  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  74.68 
 
 
155 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  80 
 
 
155 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  80 
 
 
155 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  75.5 
 
 
156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  75.86 
 
 
158 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  62.84 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  61.49 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  60.14 
 
 
158 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  52.38 
 
 
187 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  51.7 
 
 
168 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  52.03 
 
 
168 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  48.63 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 
163 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  47.02 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 
167 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  43.75 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  42.07 
 
 
151 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  40.69 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  42.07 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  46.36 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  46.36 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  46.36 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  46.36 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  46.36 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  46.36 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  38.67 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  38.67 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  44.9 
 
 
166 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  44.9 
 
 
166 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  41.67 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  41.78 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  39.47 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  41.78 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  40 
 
 
152 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  43.59 
 
 
166 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
162 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  40.82 
 
 
151 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
156 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38.62 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
156 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.93 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  41.4 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  39.61 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  37.24 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  37.91 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  37.91 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  37.93 
 
 
200 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  37.93 
 
 
156 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  37.25 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.74 
 
 
173 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.86 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  37.82 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
150 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  37.24 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  40.65 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.25 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.13 
 
 
187 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.25 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.58 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.72 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  40 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  36.67 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.41 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.69 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  36.18 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  37.33 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  38 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.81 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>