More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0020 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  99.74 
 
 		 390 aa  813    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  82.52 
 
 		 405 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  100 
 
 		 412 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  83.25 
 
 		 405 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  98.21 
 
 		 390 aa  801    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  100 
 
 		 412 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  82.28 
 
 		 405 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  100 
 
 		 412 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  100 
 
 		 412 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  100 
 
 		 412 aa  860    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  82.77 
 
 		 405 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  82.77 
 
 		 405 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  82.77 
 
 		 405 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  82.52 
 
 		 405 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  99.76 
 
 		 412 aa  858    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  69.27 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  69.02 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  69.35 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  63.44 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  63.44 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  62.3 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  56.28 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  59.63 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  53.14 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  54.4 
 
 		 423 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  54.07 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  53.89 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  49.6 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  51.25 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  47.3 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  48.88 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  47.83 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  47.54 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  48.25 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  47.14 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  43.8 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  45.33 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  50.53 
 
 		 390 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  45.53 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  46.7 
 
 		 378 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  45.78 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  47.57 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  47.7 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  44.19 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  45.56 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  41.97 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  40.87 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  41.08 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  41.69 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  40.16 
 
 		 418 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  40.27 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  41.55 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.6 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  39.42 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  39.34 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  40.33 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  38.3 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  38.03 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  38.84 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  39.66 
 
 		 379 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  38.57 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  36.95 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  37.57 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  35.51 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  36.01 
 
 		 358 aa  212  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  35.9 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  36.83 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  35.61 
 
 		 341 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.81 
 
 		 763 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.61 
 
 		 765 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  32.29 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.59 
 
 		 777 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.61 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.6 
 
 		 757 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.6 
 
 		 757 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.01 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.6 
 
 		 757 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.59 
 
 		 757 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.6 
 
 		 757 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.6 
 
 		 757 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.6 
 
 		 757 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.17 
 
 		 757 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  28.82 
 
 		 346 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  29.2 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  28.9 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  27.7 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  28.91 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  25.59 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  28.79 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  28.15 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  26.71 
 
 		 341 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  26.71 
 
 		 341 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  28.07 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  26.44 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  30.03 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  26.89 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  26.44 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  26.44 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  28.03 
 
 		 386 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  29.66 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>