More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3613 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
434 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  75.51 
 
 
435 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
434 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
432 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  73.92 
 
 
435 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
432 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  92.09 
 
 
432 aa  817    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  93.26 
 
 
432 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  92.33 
 
 
432 aa  819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  92.09 
 
 
432 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  87.62 
 
 
429 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
434 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  99.07 
 
 
432 aa  870    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  99.77 
 
 
434 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  88.42 
 
 
428 aa  770    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  72.41 
 
 
450 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  92.09 
 
 
432 aa  816    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  91.86 
 
 
432 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  92.33 
 
 
432 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  88.42 
 
 
428 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  73.7 
 
 
435 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
434 aa  885    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  71.95 
 
 
434 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  59.04 
 
 
438 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  57.67 
 
 
449 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  62.95 
 
 
414 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  61.95 
 
 
423 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 
420 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  61.65 
 
 
432 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  61.84 
 
 
435 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5475  glutamyl-tRNA reductase  56.98 
 
 
441 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  61.17 
 
 
429 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  58.96 
 
 
416 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0524  glutamyl-tRNA reductase  62.14 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.534347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  58.77 
 
 
416 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  58.11 
 
 
429 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  59.43 
 
 
436 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  57.66 
 
 
426 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1281  glutamyl-tRNA reductase  57.41 
 
 
419 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0852  glutamyl-tRNA reductase  58.47 
 
 
436 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  59.11 
 
 
418 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  50.73 
 
 
420 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  48.84 
 
 
425 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  48.84 
 
 
425 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  48.6 
 
 
425 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  48.37 
 
 
425 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  47.27 
 
 
420 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  49.07 
 
 
422 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  49.01 
 
 
421 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  48.48 
 
 
439 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  47.51 
 
 
429 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 
426 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  48.83 
 
 
422 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  50.36 
 
 
432 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  49.14 
 
 
428 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  49.16 
 
 
425 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  48.91 
 
 
424 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  46.51 
 
 
425 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  46.73 
 
 
425 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  47.52 
 
 
419 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  47.03 
 
 
423 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  49.14 
 
 
416 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  49.63 
 
 
416 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  46.29 
 
 
418 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  49.63 
 
 
416 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  49.63 
 
 
416 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  48.02 
 
 
449 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  46.64 
 
 
446 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  48.64 
 
 
416 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 
416 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  49.63 
 
 
416 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  49.38 
 
 
416 aa  364  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  47.13 
 
 
422 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  48.89 
 
 
416 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  45.93 
 
 
422 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  45.79 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  49.14 
 
 
416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  48.89 
 
 
416 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  47.41 
 
 
416 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  48.64 
 
 
418 aa  358  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  47.9 
 
 
416 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  47.07 
 
 
420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.02 
 
 
419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  46.73 
 
 
416 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  49.87 
 
 
408 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  47.41 
 
 
418 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  47.16 
 
 
426 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  48.89 
 
 
416 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  47.16 
 
 
418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  45.22 
 
 
418 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  45.22 
 
 
418 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  45.22 
 
 
418 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  45.22 
 
 
418 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  44.98 
 
 
418 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  44.61 
 
 
418 aa  350  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  46.17 
 
 
418 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  46.23 
 
 
434 aa  348  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  45.68 
 
 
418 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  45.68 
 
 
418 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  45.43 
 
 
418 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>