208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3168 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  98.97 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  98.97 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  98.97 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  98.97 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  98.91 
 
 
274 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  98.91 
 
 
274 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  95.26 
 
 
274 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  89.42 
 
 
274 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  89.42 
 
 
274 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  88.69 
 
 
274 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  88.69 
 
 
274 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  88.69 
 
 
274 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  86.13 
 
 
274 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  68.25 
 
 
274 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  68.25 
 
 
274 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  59.49 
 
 
274 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  59.12 
 
 
274 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  57.61 
 
 
276 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  57.61 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  59.22 
 
 
277 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  59.61 
 
 
277 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  58.82 
 
 
277 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  58.43 
 
 
277 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  58.04 
 
 
277 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  57.25 
 
 
277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  57.25 
 
 
277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  49.12 
 
 
282 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  49.29 
 
 
286 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  44.71 
 
 
308 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  44.31 
 
 
306 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  40.22 
 
 
241 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  35.97 
 
 
240 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  37.41 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  37.41 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  37.41 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  35.64 
 
 
241 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  34.64 
 
 
241 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  34.77 
 
 
241 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  34.64 
 
 
246 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  32.86 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  33.97 
 
 
241 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  34.13 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  35.91 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  35.71 
 
 
239 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  34.8 
 
 
243 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  34.8 
 
 
243 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  34.8 
 
 
243 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  33.97 
 
 
243 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  33.97 
 
 
243 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  34.9 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  33.97 
 
 
243 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  34.48 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  31.16 
 
 
246 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  30.74 
 
 
245 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  30.43 
 
 
498 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  30.43 
 
 
277 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  30.43 
 
 
498 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  30.69 
 
 
504 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  30.43 
 
 
498 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  30.43 
 
 
498 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  30.43 
 
 
498 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  30.32 
 
 
463 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  30.32 
 
 
464 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  30.32 
 
 
464 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  30.32 
 
 
464 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  28.97 
 
 
371 aa  116  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  28.05 
 
 
382 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  28.68 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  27.34 
 
 
228 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.17 
 
 
214 aa  79  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  24.41 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  25.1 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  26.45 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  26.18 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  25 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  24.91 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  25.81 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  26.38 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  25.78 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  23.33 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  25.09 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  25.78 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  23.66 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  24.11 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  26.07 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  24 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>