299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3090 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  96 
 
 
75 bp  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  94.67 
 
 
75 bp  117  4e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  93.33 
 
 
76 bp  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60400  tRNA-Gly  93.06 
 
 
71 bp  95.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54840  tRNA-Gly  93.06 
 
 
71 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.8368e-12  unclonable  1.75195e-22 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  98.08 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0089  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0007  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  1.40906e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0007  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.13428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0007  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0013  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.81775e-06  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0007  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000568475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0082  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000798848  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2801  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.58752e-10  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4287  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0048  tRNA-Gly  90.67 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  96 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  96 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  94.23 
 
 
74 bp  79.8  8e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  94.23 
 
 
74 bp  79.8  8e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  94.23 
 
 
74 bp  79.8  8e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.10087e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  94.23 
 
 
74 bp  79.8  8e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1121t  tRNA-OTHER  92.86 
 
 
69 bp  79.8  8e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  88 
 
 
78 bp  77.8  3e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.88593e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  3.16853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.14766e-09  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  2.23193e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.54336e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.04012e-08  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  7.78472e-05  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.8079e-06  hitchhiker  7.85716e-15 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  95.74 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.72543e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R23  tRNA-Gly  89.33 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.60652e-06  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  9.95593e-08  hitchhiker  7.87361e-13 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.39048e-11  hitchhiker  4.76038e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  95.74 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  4.23625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.13588e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.91266e-06  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  3.45033e-06  hitchhiker  1.21992e-12 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  6.1566e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06159  tRNA-Gly  90.32 
 
 
72 bp  75.8  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00235  tRNA-Gly  90.32 
 
 
72 bp  75.8  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  93.88 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  93.88 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  93.88 
 
 
71 bp  73.8  5e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  95.92 
 
 
75 bp  73.8  5e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  92.31 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  90.91 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  88 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  88 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06802  tRNA-Gly  90.91 
 
 
72 bp  69.9  8e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  88 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3206t  tRNA-OTHER  90.91 
 
 
72 bp  69.9  8e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0593259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  90.91 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02828  tRNA-Gly  90.91 
 
 
72 bp  69.9  8e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  88 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  93.62 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1112t  tRNA-Gly  90.91 
 
 
72 bp  69.9  8e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  88 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  93.62 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  93.48 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  93.48 
 
 
71 bp  67.9  3e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.23712e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  91.84 
 
 
71 bp  65.9  1e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.93473e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  1e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  91.84 
 
 
71 bp  65.9  1e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  90.38 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  4.47795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  90.38 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  2.2788e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0056  tRNA-Gly  90.38 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126363  hitchhiker  3.7028e-06 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  90.38 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>