67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2576 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  100 
 
 
1751 aa  713  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  93.18 
 
 
470 aa  853  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  99.79 
 
 
466 aa  914  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  915  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  915  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  99.79 
 
 
466 aa  913  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  915  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  915  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  42.83 
 
 
470 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  36.72 
 
 
455 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  41.16 
 
 
465 aa  289  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  41.74 
 
 
474 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.74 
 
 
474 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  34.86 
 
 
445 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  39 
 
 
473 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  33.77 
 
 
442 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.7 
 
 
443 aa  229  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  34.14 
 
 
466 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  35.94 
 
 
467 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  38.48 
 
 
469 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  35.11 
 
 
467 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 
445 aa  219  8e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  38.04 
 
 
469 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.11 
 
 
468 aa  218  3e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  36.46 
 
 
471 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.26 
 
 
460 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.26 
 
 
460 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  35.56 
 
 
464 aa  216  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.04 
 
 
453 aa  215  2e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.53 
 
 
460 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  34.47 
 
 
471 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  34.78 
 
 
473 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  39.07 
 
 
462 aa  201  2e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  32.03 
 
 
479 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.84 
 
 
475 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
485 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
480 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.17 
 
 
482 aa  184  2e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  31.24 
 
 
456 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.83 
 
 
481 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.24 
 
 
455 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  31.75 
 
 
453 aa  182  9e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.68 
 
 
883 aa  181  3e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  32.4 
 
 
455 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  31.72 
 
 
444 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30.5 
 
 
499 aa  163  5e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  30.79 
 
 
454 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
478 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  29.72 
 
 
466 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  29.82 
 
 
478 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  27.85 
 
 
468 aa  130  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
523 aa  130  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.56 
 
 
468 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.71 
 
 
506 aa  115  2e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  29.14 
 
 
633 aa  112  2e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.4 
 
 
608 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  23.79 
 
 
458 aa  80.1  8e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  28.4 
 
 
490 aa  71.6  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  21.98 
 
 
500 aa  68.9  2e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  21.98 
 
 
500 aa  68.9  2e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  21.98 
 
 
494 aa  67.4  5e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  26.4 
 
 
507 aa  58.2  4e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  23.12 
 
 
533 aa  56.2  1e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  30.29 
 
 
477 aa  53.5  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  32.58 
 
 
125 aa  52.8  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
479 aa  50.1  9e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  26.74 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>