275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2039 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  93.13 
 
 		 425 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  70.5 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  43.54 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  45.59 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  43.34 
 
 		 426 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  42.69 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.17 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  39.29 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 		 429 aa  269  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.22 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 		 409 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 428 aa  265  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.88 
 
 		 447 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  40.19 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 		 412 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 		 429 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  39.61 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  38.93 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.29 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.58 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  40.29 
 
 		 418 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.23 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  39.78 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  37.15 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  40.21 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  38.8 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 429 aa  232  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  38.8 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  38.8 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  37.31 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.58 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  37.44 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.47 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  35.68 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.27 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  33.91 
 
 		 416 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  37.93 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.88 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  37.96 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  38.58 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.29 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.82 
 
 		 426 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.12 
 
 		 420 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.12 
 
 		 420 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.49 
 
 		 424 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.74 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.11 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.92 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  37.94 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.08 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.92 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  36.55 
 
 		 411 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.55 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.62 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  38.96 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  37.75 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  39.4 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  37.56 
 
 		 421 aa  213  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  37.19 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  36.39 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  34.11 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  36.12 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.96 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.29 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  39.79 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.6 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.18 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>