More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2038 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  91.15 
 
 
230 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  91.15 
 
 
224 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  91.15 
 
 
224 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  91.15 
 
 
224 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  91.15 
 
 
224 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  90.27 
 
 
224 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  82.14 
 
 
224 aa  191  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  71.93 
 
 
231 aa  166  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  68.81 
 
 
233 aa  154  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  66.06 
 
 
221 aa  148  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  65.14 
 
 
221 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  64.81 
 
 
221 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  59.46 
 
 
228 aa  137  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 
222 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  60.71 
 
 
114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
221 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
227 aa  130  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 
218 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
223 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
222 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  57.27 
 
 
218 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
223 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
235 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
235 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
227 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
235 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  55.77 
 
 
218 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  54.9 
 
 
226 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  50.39 
 
 
221 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
218 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
234 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 
227 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  55.77 
 
 
223 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
226 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
226 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  45.79 
 
 
221 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
220 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
222 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
219 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  40.71 
 
 
184 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 
189 aa  96.7  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
221 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
253 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  44.12 
 
 
219 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
232 aa  85.1  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  50 
 
 
128 aa  76.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  42.06 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  40.34 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
470 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.43 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  45.05 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.28 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.79 
 
 
550 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  45 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  43.68 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 
478 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  43.82 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  43.27 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 
459 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
269 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  45.35 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.28 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37 
 
 
813 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.45 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.85 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.56 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.74 
 
 
361 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.44 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.43 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
480 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  43.88 
 
 
565 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  41.24 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  37.38 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>