More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2016 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2016  argininosuccinate synthase  100 
 
 
404 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000804601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1996  argininosuccinate synthase  100 
 
 
404 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2152  argininosuccinate synthase  100 
 
 
404 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  45.69 
 
 
410 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  43.73 
 
 
1496 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  46.87 
 
 
411 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  45.23 
 
 
408 aa  355  8.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  45.41 
 
 
410 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  44.53 
 
 
397 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
401 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  46.12 
 
 
412 aa  352  8e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  45.86 
 
 
412 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  43.88 
 
 
405 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  46.8 
 
 
407 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  47.47 
 
 
404 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  44.86 
 
 
401 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  45.43 
 
 
416 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  46.35 
 
 
412 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  43.61 
 
 
401 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
409 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  45.16 
 
 
413 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  45.41 
 
 
412 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  45.34 
 
 
407 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
402 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  42.75 
 
 
403 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 
409 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  45.84 
 
 
405 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  45.45 
 
 
409 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  44.91 
 
 
413 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  45.16 
 
 
413 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  45.05 
 
 
413 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  45.59 
 
 
406 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  45.59 
 
 
406 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  45.3 
 
 
406 aa  341  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  45 
 
 
403 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  44.42 
 
 
407 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  45.11 
 
 
409 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  45.71 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  42.75 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  41.5 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  45.55 
 
 
413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  44.64 
 
 
419 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  44.84 
 
 
409 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  45.23 
 
 
407 aa  338  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  43.9 
 
 
405 aa  338  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  42.49 
 
 
399 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  45.8 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  42.47 
 
 
403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  44.74 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  45.91 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  44.78 
 
 
405 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  43.86 
 
 
405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  44.16 
 
 
401 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
396 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  44 
 
 
405 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  44.42 
 
 
407 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  44.42 
 
 
409 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  44.28 
 
 
405 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
406 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  42.72 
 
 
406 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  45.3 
 
 
410 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  44.67 
 
 
409 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  44.14 
 
 
406 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  44.28 
 
 
405 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  42.75 
 
 
401 aa  334  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  43.93 
 
 
401 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  45.06 
 
 
406 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  43.36 
 
 
405 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  40.75 
 
 
407 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  43.07 
 
 
407 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  43.46 
 
 
409 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
408 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  44.2 
 
 
403 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  44.89 
 
 
399 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  43.86 
 
 
405 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  44.89 
 
 
399 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  42.67 
 
 
403 aa  332  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  44.3 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  43.36 
 
 
403 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  43.42 
 
 
406 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  41.73 
 
 
404 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
407 aa  332  9e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
399 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  44.13 
 
 
407 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  45.05 
 
 
410 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  41.5 
 
 
407 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
404 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  44 
 
 
407 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  43.5 
 
 
408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  43.5 
 
 
408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  40.82 
 
 
407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  43.95 
 
 
406 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  43.95 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  43.47 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  42.96 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  43.75 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  43.18 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  43.03 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  43.81 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
407 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>