22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1795 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1795  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000175143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1949  hypothetical protein  99.21 
 
 
126 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000272538  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1042  hypothetical protein  92.97 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0123  hypothetical protein  92.97 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000625285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1774  hypothetical protein  92.86 
 
 
122 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0042105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1772  hypothetical protein  90.62 
 
 
125 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2536  hypothetical protein  83.67 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2792  hypothetical protein  46.23 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1726  hypothetical protein  48.15 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000356622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1409  hypothetical protein  50.59 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1449  hypothetical protein  44.16 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1659  hypothetical protein  64 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69389  normal  0.537335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1503  hypothetical protein  51.95 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000219936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1527  hypothetical protein  51.95 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.149151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1047  hypothetical protein  51.95 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4667  hypothetical protein  50.6 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613007  decreased coverage  0.000608941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5415  putative lipoprotein  42.65 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2327  hypothetical protein  41.79 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3660  hypothetical protein  32.88 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4397  hypothetical protein  35.71 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02588  signal peptide protein  34.83 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.64703  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55840  hypothetical protein  36.71 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>