85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1787 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  100 
 
 		 155 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  100 
 
 		 155 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  100 
 
 		 155 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  100 
 
 		 155 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  94.84 
 
 		 155 aa  267  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  66.67 
 
 		 164 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  64.71 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  64.71 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  64.71 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  58.62 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  50 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  50.34 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  43.21 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  44.97 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  46.15 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  39.02 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  37.97 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  39.19 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  32.05 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  32.57 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  40.67 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  40.38 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  29.93 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  38.13 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  38.13 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  39.5 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  30.25 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  31.29 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  30.25 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  46.43 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  40.74 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  28.28 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  51.06 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  49.06 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  41.67 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  29.27 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  35.92 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  45.83 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  46 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  40.32 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  30.6 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  30.33 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.43 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  31.62 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  33.96 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  44.68 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  38.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.38 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.77 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  24.52 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  29.82 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  26.09 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  41.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  28.99 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  42.86 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  52.94 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  29.05 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  32.2 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  32.2 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  32.2 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  32.2 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  32.2 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  32.2 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  42.25 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  27.92 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  40.74 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  28.93 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  38 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  40.68 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  26.23 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.86 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  30.67 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  32.31 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  40 
 
 		 165 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  24.32 
 
 		 152 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  29.09 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  35.09 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2343  hypothetical protein  38.27 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  35.85 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  36.96 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>