45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1618 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  99.61 
 
 
343 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  99.23 
 
 
306 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  86.77 
 
 
343 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  77.83 
 
 
247 aa  354  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  77.46 
 
 
235 aa  350  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  81.82 
 
 
220 aa  345  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1381  hypothetical protein  98.46 
 
 
130 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0859  hypothetical protein  98.46 
 
 
130 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0494  hypothetical protein  99.17 
 
 
121 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0663  hypothetical protein  99.17 
 
 
121 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  43.24 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  39 
 
 
309 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  38.02 
 
 
262 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  33.8 
 
 
379 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  40.54 
 
 
313 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  31.64 
 
 
376 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  33.97 
 
 
321 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  35.68 
 
 
308 aa  98.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  31.94 
 
 
376 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  31.22 
 
 
362 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  30.1 
 
 
360 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  29.05 
 
 
357 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  29.52 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  29.67 
 
 
280 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  30.1 
 
 
360 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  29.21 
 
 
358 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  31.12 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  28.8 
 
 
358 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  31.41 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  33.81 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  26.26 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  25.91 
 
 
372 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  26.91 
 
 
385 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  35.05 
 
 
308 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  34.38 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  25.99 
 
 
375 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  29.57 
 
 
376 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  35.11 
 
 
373 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  35.11 
 
 
377 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  25.56 
 
 
368 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3852  hypothetical protein  31.68 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0038  hypothetical protein  30.89 
 
 
338 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0841  hypothetical protein  32.26 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3853  hypothetical protein  31.68 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>