181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1556 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  99.34 
 
 
630 aa  1198    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  99.83 
 
 
659 aa  1204    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 
639 aa  882    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  85.43 
 
 
648 aa  1007    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
604 aa  1197    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  99.34 
 
 
630 aa  1198    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
604 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
604 aa  1206    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
604 aa  1197    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  46.45 
 
 
311 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  41.7 
 
 
285 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  43.82 
 
 
285 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  43.26 
 
 
285 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
342 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
342 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  43.75 
 
 
276 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  44.66 
 
 
276 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
343 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
342 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
342 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
343 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  43.16 
 
 
287 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  43.26 
 
 
285 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  41.92 
 
 
292 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  42.81 
 
 
287 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  42.81 
 
 
287 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
342 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
343 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  41.75 
 
 
286 aa  177  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
343 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  44.86 
 
 
280 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.83 
 
 
342 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  40.85 
 
 
285 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  42.25 
 
 
293 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  40.78 
 
 
286 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.13 
 
 
342 aa  171  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  40.78 
 
 
286 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  39.65 
 
 
286 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  40 
 
 
289 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  40.36 
 
 
285 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  43.95 
 
 
292 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  40 
 
 
285 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  39.5 
 
 
286 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
286 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  39.5 
 
 
286 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  39.5 
 
 
286 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  39.5 
 
 
286 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  39.5 
 
 
286 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  39.15 
 
 
286 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
286 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  33.58 
 
 
284 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  27.02 
 
 
306 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  27.02 
 
 
306 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  26.67 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  26.86 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  26.32 
 
 
306 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  26.32 
 
 
306 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  28.22 
 
 
306 aa  114  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  27.37 
 
 
306 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  26.32 
 
 
304 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  32.29 
 
 
310 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  32.13 
 
 
292 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  31.27 
 
 
297 aa  104  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  32.58 
 
 
307 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  33.66 
 
 
295 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  33.01 
 
 
306 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  30.95 
 
 
291 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  30.23 
 
 
311 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  31.31 
 
 
306 aa  97.4  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  30.68 
 
 
290 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  32.85 
 
 
301 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  33.07 
 
 
298 aa  91.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  32.76 
 
 
351 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  32.44 
 
 
290 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  24.82 
 
 
296 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  33.66 
 
 
296 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  32.04 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  30.67 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  26.22 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  32.6 
 
 
307 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  30.07 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 
253 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  36.17 
 
 
301 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  26.22 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  31.91 
 
 
312 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  25.78 
 
 
253 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  35.67 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  33.85 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  33.82 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  31.91 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  31.91 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  38.26 
 
 
278 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  34.36 
 
 
306 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  24.78 
 
 
315 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  35.96 
 
 
309 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3997  putative methyltransferase  30.22 
 
 
288 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263514  normal  0.13197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>