More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1539 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  70.96 
 
 
557 aa  760    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  78.74 
 
 
539 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  99.81 
 
 
555 aa  1077    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  69.72 
 
 
553 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  99.82 
 
 
541 aa  1079    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  79.11 
 
 
539 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  79.63 
 
 
539 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  99.81 
 
 
541 aa  1076    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  92.04 
 
 
541 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  78.93 
 
 
539 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  70.28 
 
 
556 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
541 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  99.26 
 
 
555 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  78.74 
 
 
539 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  99.81 
 
 
541 aa  1076    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  78.93 
 
 
539 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  99.81 
 
 
541 aa  1076    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  78.74 
 
 
539 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  58.44 
 
 
535 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  55.87 
 
 
576 aa  591  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  55.47 
 
 
535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  56.61 
 
 
544 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  57.43 
 
 
538 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  51.57 
 
 
551 aa  558  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  55.37 
 
 
535 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  51.39 
 
 
547 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 
562 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  52.13 
 
 
543 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  51.76 
 
 
532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  51.02 
 
 
543 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  54.92 
 
 
562 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  54.73 
 
 
562 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  53.87 
 
 
539 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  49.81 
 
 
513 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  44.98 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 
576 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  48.95 
 
 
526 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 
595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  42.09 
 
 
603 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 
558 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  41.56 
 
 
562 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 
552 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
552 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
522 aa  339  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 
541 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
537 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
616 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  40.42 
 
 
561 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  35.14 
 
 
586 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
552 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
549 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
555 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
560 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
571 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  40 
 
 
556 aa  316  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  40.4 
 
 
555 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 
566 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  41 
 
 
555 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
548 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  41 
 
 
555 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 
525 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 
609 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  35.37 
 
 
572 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  36.9 
 
 
585 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  35.74 
 
 
572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 
554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  36.04 
 
 
572 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
555 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 
555 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  38.35 
 
 
588 aa  306  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 
555 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  34.08 
 
 
568 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  34.08 
 
 
568 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
555 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  34.39 
 
 
571 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 
557 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 
557 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  36.83 
 
 
588 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  36.83 
 
 
588 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 
547 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
549 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  34.08 
 
 
571 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 
592 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
548 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
555 aa  293  6e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
530 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
563 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 
553 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  35.59 
 
 
598 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 
552 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>