More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1500 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  99.77 
 
 
430 aa  828  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  99.51 
 
 
412 aa  793  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  99.76 
 
 
412 aa  795  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  99.51 
 
 
412 aa  793  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  829  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  99.76 
 
 
412 aa  795  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  99.51 
 
 
412 aa  793  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  95.13 
 
 
412 aa  696  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.99606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  75.12 
 
 
413 aa  607  1e-172  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  77.15 
 
 
414 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  74.88 
 
 
413 aa  575  1e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  75.94 
 
 
405 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.64132e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  76.94 
 
 
405 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  76.94 
 
 
405 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  77.44 
 
 
405 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  76.23 
 
 
410 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  75.49 
 
 
410 aa  538  1e-152  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  72.06 
 
 
410 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  58.93 
 
 
425 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  54.16 
 
 
418 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  40.1 
 
 
405 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  38.88 
 
 
420 aa  239  7e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  37.86 
 
 
420 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  36.95 
 
 
420 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  34.79 
 
 
427 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  40.3 
 
 
407 aa  217  3e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  30.02 
 
 
415 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  38.25 
 
 
407 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
431 aa  185  1e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  34.79 
 
 
412 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  39.62 
 
 
461 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
392 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  34.37 
 
 
416 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
415 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  32.77 
 
 
423 aa  149  1e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
395 aa  149  1e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  28.96 
 
 
445 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  33.79 
 
 
412 aa  140  5e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
412 aa  139  9e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
493 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  28.9 
 
 
434 aa  136  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  28.67 
 
 
434 aa  135  1e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  29.53 
 
 
431 aa  133  7e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.88 
 
 
432 aa  128  2e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
414 aa  122  2e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  33.45 
 
 
417 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
425 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.38 
 
 
428 aa  112  1e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
413 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
415 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
411 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.97 
 
 
418 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  35.9 
 
 
417 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
446 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.58 
 
 
418 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23.98 
 
 
406 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  25.29 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22.99 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22.63 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
439 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  31.76 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.41 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  27.68 
 
 
389 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
420 aa  93.6  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
411 aa  94  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
436 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.09 
 
 
420 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  27.34 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  28.49 
 
 
407 aa  90.1  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  31.47 
 
 
390 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.59 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.93 
 
 
434 aa  86.3  1e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  23.54 
 
 
432 aa  85.5  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  27.02 
 
 
432 aa  84.7  3e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  84.3  4e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  24.84 
 
 
366 aa  84  4e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  24.84 
 
 
366 aa  84.3  4e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
441 aa  84.3  4e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.15 
 
 
432 aa  84  4e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  28.18 
 
 
451 aa  83.6  6e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  28.66 
 
 
433 aa  83.6  6e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
437 aa  83.2  8e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.22 
 
 
430 aa  82.8  1e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  23.22 
 
 
430 aa  82.4  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
371 aa  82  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  24.49 
 
 
432 aa  80.5  6e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  27.59 
 
 
452 aa  80.1  7e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  27.59 
 
 
452 aa  80.1  8e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.5 
 
 
426 aa  79.7  8e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.82 
 
 
434 aa  79  1e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.7 
 
 
426 aa  78.6  2e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.83 
 
 
460 aa  79  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
460 aa  78.6  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.01 
 
 
430 aa  78.6  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  29.88 
 
 
397 aa  78.2  3e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  24.15 
 
 
434 aa  77.4  4e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>