More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1442 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  79.46 
 
 
404 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  100 
 
 
404 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  75.62 
 
 
462 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  64.52 
 
 
404 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  62.09 
 
 
404 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  57.5 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  56.44 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  55.99 
 
 
413 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  54.5 
 
 
403 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  54.29 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  54.63 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  75.82 
 
 
276 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  54.98 
 
 
406 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  55.06 
 
 
411 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  55.2 
 
 
445 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  52.43 
 
 
420 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  52.5 
 
 
406 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  52.42 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  51.67 
 
 
429 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  50.99 
 
 
407 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  52.41 
 
 
378 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  49.75 
 
 
410 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  50.62 
 
 
409 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  48.09 
 
 
394 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  46.54 
 
 
433 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  46.78 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  46.39 
 
 
428 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  48.63 
 
 
419 aa  359  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  45.72 
 
 
404 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  47.12 
 
 
413 aa  349  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  46.21 
 
 
404 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  46.21 
 
 
404 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  46.84 
 
 
405 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  47.78 
 
 
412 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  43.18 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  43.18 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  48.24 
 
 
403 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  43.18 
 
 
404 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  42.79 
 
 
402 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  45.25 
 
 
421 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.75 
 
 
404 aa  332  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  44.99 
 
 
404 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  44.28 
 
 
412 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  44.92 
 
 
391 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  42.71 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  42.25 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  42.25 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  42.25 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.62 
 
 
402 aa  315  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  43.98 
 
 
403 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  42.37 
 
 
412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  43.29 
 
 
404 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  41.07 
 
 
402 aa  308  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  42.28 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  42.28 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  42.79 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  43.46 
 
 
412 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  43.17 
 
 
415 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  42.49 
 
 
417 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  41.49 
 
 
425 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  42.49 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  40.97 
 
 
395 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  41.54 
 
 
409 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  40.95 
 
 
404 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  40.53 
 
 
425 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  40.98 
 
 
413 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  41.03 
 
 
410 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  41.62 
 
 
396 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  43.75 
 
 
367 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  40.55 
 
 
397 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  42.68 
 
 
404 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.01 
 
 
420 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  39.49 
 
 
397 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  39.11 
 
 
420 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  38.57 
 
 
419 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  40.05 
 
 
428 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  38.33 
 
 
419 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.22 
 
 
394 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.97 
 
 
394 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  41.22 
 
 
396 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  41.25 
 
 
402 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  42.82 
 
 
401 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  38.27 
 
 
421 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.15 
 
 
396 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  40.95 
 
 
417 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  38.12 
 
 
421 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  40.2 
 
 
419 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  38.02 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  39.71 
 
 
424 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  41.41 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.78 
 
 
421 aa  285  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  42.12 
 
 
425 aa  285  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  43.14 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  38.63 
 
 
412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  39.71 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  39.71 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  39.23 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  40.82 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  42.78 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  39.95 
 
 
419 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>