176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1365 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  94.74 
 
 
209 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.69 
 
 
209 aa  358  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.38 
 
 
209 aa  337  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.38 
 
 
209 aa  337  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.38 
 
 
209 aa  337  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.73 
 
 
209 aa  321  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.25 
 
 
209 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.43 
 
 
209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.89 
 
 
212 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 
212 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
215 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.41 
 
 
211 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 
213 aa  108  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
212 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  32.24 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
211 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
214 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  34.93 
 
 
210 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
209 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  32.43 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  35.76 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  33.02 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
230 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  26.85 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30.37 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  30.32 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.07 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  27.19 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  27.19 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  29.74 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.83 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.5 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  30.45 
 
 
229 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  28.64 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.84 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  29.49 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  31.34 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  27.31 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  29.09 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.79 
 
 
267 aa  58.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  33.74 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  29.07 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  26.04 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  26.04 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  34.52 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.06 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  32.69 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
296 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  28.03 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
299 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.7 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  24.55 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.96 
 
 
321 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  29.9 
 
 
366 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
320 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  23.51 
 
 
294 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  26.13 
 
 
212 aa  52  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  25.89 
 
 
257 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  32.08 
 
 
212 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  25.89 
 
 
257 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
306 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  33.66 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  31.9 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>