More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1042 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  99.71 
 
 
350 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  99.43 
 
 
350 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  99.71 
 
 
350 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  100 
 
 
350 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  99.14 
 
 
350 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  100 
 
 
350 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  90.57 
 
 
350 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  72.43 
 
 
339 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  69.18 
 
 
333 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  67.68 
 
 
356 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  72.35 
 
 
339 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  68.06 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  71.55 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.67 
 
 
339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  72.94 
 
 
338 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  72.94 
 
 
338 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  72.14 
 
 
339 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  55.76 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  56.51 
 
 
343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  54.44 
 
 
340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  56.36 
 
 
335 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  56.59 
 
 
350 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  53.31 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  51.79 
 
 
336 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  47.89 
 
 
331 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  48.77 
 
 
335 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  49.25 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  47.56 
 
 
330 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  49.24 
 
 
341 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  50 
 
 
331 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  48.32 
 
 
330 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  44.58 
 
 
334 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  47.45 
 
 
330 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  49.39 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  48.63 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  48.49 
 
 
341 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  45.48 
 
 
334 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  43.28 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  48.93 
 
 
330 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  43.7 
 
 
354 aa  222  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  46.65 
 
 
328 aa  219  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  48.32 
 
 
330 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  52.48 
 
 
321 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  41.57 
 
 
331 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  44.28 
 
 
332 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.28 
 
 
332 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  36.09 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  41.96 
 
 
326 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  42.34 
 
 
318 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.04 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.64 
 
 
519 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  38.21 
 
 
325 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  37.91 
 
 
350 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  41.52 
 
 
343 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 
329 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.25 
 
 
331 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  39.09 
 
 
347 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.55 
 
 
338 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  38.25 
 
 
346 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
347 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.07 
 
 
340 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  40.45 
 
 
337 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  40 
 
 
333 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.14 
 
 
332 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.76 
 
 
328 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  41.72 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  37.72 
 
 
331 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.14 
 
 
352 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  39.25 
 
 
324 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  39.41 
 
 
327 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.6 
 
 
336 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.31 
 
 
344 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  37.58 
 
 
320 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  38.11 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.88 
 
 
335 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  29.77 
 
 
344 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 
365 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  39.7 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  38.37 
 
 
324 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 
329 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.56 
 
 
332 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.82 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.52 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.77 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  32.7 
 
 
858 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.01 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  32 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  30.25 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  32 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.48 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  30.91 
 
 
364 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.77 
 
 
358 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.98 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  31.27 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  24.6 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.96 
 
 
498 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.95 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.35 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>