More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0612 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  98.77 
 
 
243 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  98.77 
 
 
356 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  88.89 
 
 
242 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  45.9 
 
 
246 aa  194  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.1 
 
 
264 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  40.51 
 
 
264 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  42.19 
 
 
237 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  42.15 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  36.29 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  38.4 
 
 
261 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  40.42 
 
 
237 aa  159  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  41.35 
 
 
263 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  38.59 
 
 
263 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
258 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  41.42 
 
 
239 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  35.44 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  38.59 
 
 
263 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  39.08 
 
 
238 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  39.08 
 
 
238 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  36.89 
 
 
263 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  38.27 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  38.59 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  38.17 
 
 
263 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  38.17 
 
 
262 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  37.19 
 
 
267 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  38.52 
 
 
263 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  40 
 
 
270 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  39.34 
 
 
269 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  37.24 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  36.48 
 
 
262 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  37.5 
 
 
261 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  36.07 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  37.34 
 
 
263 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  36.67 
 
 
268 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  38.08 
 
 
262 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  37.4 
 
 
256 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  40.17 
 
 
262 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  37.87 
 
 
241 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  38.66 
 
 
249 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  38.67 
 
 
234 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  37.39 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  36.13 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  36.1 
 
 
250 aa  132  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  32.07 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  33.99 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  33.99 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  33.99 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  34.58 
 
 
261 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  36.1 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  36 
 
 
280 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  36.51 
 
 
242 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  35.02 
 
 
260 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  38.66 
 
 
234 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
264 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  30.93 
 
 
257 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  35.02 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  35.68 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  35.16 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  35.02 
 
 
241 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  36.25 
 
 
241 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  34.62 
 
 
234 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  32.63 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  36.25 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  32.92 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  31.12 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
254 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  31.12 
 
 
245 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  28.88 
 
 
245 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  37.13 
 
 
269 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  35.81 
 
 
271 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  36.07 
 
 
237 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  31.4 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  32.2 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 
296 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  28.39 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  27.85 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  29.91 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.4 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  28.21 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  23.69 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  27.35 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  23.29 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>