More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0488 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  90.6 
 
 		 500 aa  804    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  80.28 
 
 		 502 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  89.4 
 
 		 500 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  84.72 
 
 		 444 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  100 
 
 		 478 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  85.52 
 
 		 504 aa  789    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  98.54 
 
 		 469 aa  812    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  85.69 
 
 		 503 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  81.6 
 
 		 499 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  80.24 
 
 		 501 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  89.2 
 
 		 500 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  86.4 
 
 		 497 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  89.2 
 
 		 500 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  100 
 
 		 500 aa  974    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  100 
 
 		 500 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  69.41 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  69.41 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  64.41 
 
 		 431 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  62.14 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  61.49 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  63.81 
 
 		 459 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  64.35 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  61.74 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  60.84 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  60.95 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  62.13 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  58.05 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  61.72 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  64.1 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  66.67 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  62.11 
 
 		 466 aa  475  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  64.57 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  65.79 
 
 		 444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  68.04 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  61.43 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  56.16 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  63.68 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  52.84 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  61.23 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  65.95 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  63.59 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  65.31 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  65.95 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  57.89 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  55.76 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  54.98 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  54.84 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  52.62 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  52.06 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  55 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  52.4 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  56.64 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  54.61 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  54.32 
 
 		 510 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  53.39 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  56.26 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  53.83 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  55.25 
 
 		 504 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  54.53 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  52.31 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  51.55 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  52.21 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  55.56 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  54.59 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  51.64 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  49.04 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  55.18 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  52.51 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  53.9 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  54.57 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  53.23 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  56.69 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  51.59 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  55.21 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  52.26 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  53.08 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  52.71 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  57.78 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  53.33 
 
 		 431 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  53.35 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  51.33 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0172  putative ammonium transporter transmembrane protein  55.33 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17564  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0121  ammonium transporter  55.02 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0596893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.63 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.87 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  53.4 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  51.77 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  52.63 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  52.59 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  52.47 
 
 		 432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  55.21 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  53.1 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  49.36 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  53.33 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  53.16 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  52.08 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  49.2 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  49.2 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  55.18 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  52.08 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>