25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0087 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  55.07 
 
 
294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  44.97 
 
 
301 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  37.88 
 
 
311 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  35.67 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  37.21 
 
 
291 aa  182  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  38.76 
 
 
334 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  36.62 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  34.31 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  41.15 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  33.81 
 
 
281 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  33.66 
 
 
299 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  29.21 
 
 
279 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  35.41 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  29.31 
 
 
298 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  28.47 
 
 
308 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  30.04 
 
 
271 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  28.07 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  24.41 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  28.89 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  24.14 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  23.13 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>