16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0078 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  98.76 
 
 
285 aa  333  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  98.76 
 
 
237 aa  330  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  96.89 
 
 
285 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  96.89 
 
 
285 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  96.89 
 
 
285 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  87.77 
 
 
153 aa  224  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  53.52 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  52.82 
 
 
158 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  48.21 
 
 
170 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  54.55 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  53.41 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  56.79 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  45.87 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  41 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  40.85 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>