More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0068 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0070  AraC family transcriptional regulator  98.78 
 
 		 406 aa  769    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0284  AraC family transcription regulator  100 
 
 		 333 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0059  AraC family transcription regulator  89.29 
 
 		 404 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0068  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 409 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3481  transcriptional regulator  98.44 
 
 		 336 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1826  AraC/XylS family transcription factor  98.44 
 
 		 336 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2727  AraC family transcription regulator  98.44 
 
 		 336 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3849  transcriptional regulator, AraC family  71.74 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4926  transcriptional regulator, AraC family  71.74 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.949347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 334 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 340 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  33 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  28.44 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 328 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  38.28 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 317 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  26.39 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 324 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.06 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  28.07 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  29.76 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 320 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 314 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 315 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  32.49 
 
 		 350 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  30.84 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  30.08 
 
 		 320 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 342 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 323 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 319 aa  96.3  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 356 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  28.01 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3293  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 326 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>