More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0039 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
288 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
288 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
288 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  98.87 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  91.7 
 
 
265 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  90.94 
 
 
265 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  90.94 
 
 
265 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  90.57 
 
 
265 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  90.19 
 
 
265 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  90.57 
 
 
265 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  90.57 
 
 
265 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  86.04 
 
 
265 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  86.42 
 
 
264 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  86.42 
 
 
264 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  71.32 
 
 
279 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  72.76 
 
 
272 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  71.54 
 
 
285 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  71.65 
 
 
272 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  70.82 
 
 
272 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  70.77 
 
 
272 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  65.87 
 
 
264 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  56.76 
 
 
270 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  56.37 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  54.58 
 
 
275 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.2 
 
 
270 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  55.12 
 
 
267 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  55.81 
 
 
270 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  55.21 
 
 
269 aa  294  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  55.21 
 
 
270 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  54.83 
 
 
270 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  56.2 
 
 
274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  52.61 
 
 
281 aa  281  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  52.57 
 
 
286 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  53.52 
 
 
272 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  53.33 
 
 
285 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  52.17 
 
 
268 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  52.73 
 
 
281 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  51.74 
 
 
281 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  51.35 
 
 
273 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  51.35 
 
 
273 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  53.46 
 
 
292 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  53.08 
 
 
292 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  51.74 
 
 
281 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  51.78 
 
 
269 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 
261 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 
270 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  49.24 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.04 
 
 
251 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.3 
 
 
288 aa  244  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.42 
 
 
258 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 
254 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48 
 
 
283 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.7 
 
 
292 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.47 
 
 
307 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
281 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.73 
 
 
269 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.13 
 
 
306 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.44 
 
 
263 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.84 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  43.75 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.4 
 
 
252 aa  225  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.84 
 
 
254 aa  225  6e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.23 
 
 
254 aa  225  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.44 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  44.87 
 
 
276 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
267 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.33 
 
 
246 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
260 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.1 
 
 
303 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.1 
 
 
303 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.1 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.39 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
308 aa  221  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.57 
 
 
273 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.68 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.18 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
252 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.44 
 
 
263 aa  218  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50 
 
 
261 aa  218  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.92 
 
 
279 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.41 
 
 
304 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  42.08 
 
 
266 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  46.5 
 
 
284 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  42.41 
 
 
275 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
278 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.26 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.92 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.63 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.26 
 
 
304 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  44.4 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>