More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0035 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  278  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  98.59 
 
 		 183 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  90.65 
 
 		 164 aa  246  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  71.94 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  68 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  62.1 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  74.17 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  63.2 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  72.5 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  65.6 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  64.8 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  52.55 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 141 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  40.83 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  33.61 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  36.36 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  39.5 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  39.85 
 
 		 169 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  31.93 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  30.99 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  36.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  34.97 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  36.09 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.15 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.51 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.06 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  32.62 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0225  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.43 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  33.6 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  52.38 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  31.71 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  29.37 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.67 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.13 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>