83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0014 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  100 
 
 
136 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  100 
 
 
136 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  99.26 
 
 
136 aa  269  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  99.26 
 
 
136 aa  269  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  99.26 
 
 
136 aa  269  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  100 
 
 
134 aa  267  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  99.25 
 
 
134 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  94.03 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  81.62 
 
 
133 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  81.62 
 
 
133 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  81.62 
 
 
133 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  83.59 
 
 
133 aa  189  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  87.7 
 
 
145 aa  189  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  81.4 
 
 
133 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  84.62 
 
 
117 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  75.4 
 
 
143 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  75.21 
 
 
138 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  73.55 
 
 
138 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  52.89 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  52.89 
 
 
132 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  56.41 
 
 
135 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  56.78 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  53.72 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  49.21 
 
 
146 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  44.04 
 
 
136 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  44.72 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  46.72 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  46.73 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  43.3 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  41.9 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  43 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  37.96 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  42.86 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  40.82 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  39.42 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  40 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  36.73 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  31.67 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  31.9 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  31.62 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  38.95 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  48.74 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  49.57 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  30.97 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  27.73 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  37.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  30.36 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  30.36 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  30.17 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  36.78 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  29.73 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  29.46 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  30.97 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  29.41 
 
 
134 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  35.92 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  30.48 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  41.27 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  33.67 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  37 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  29.66 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  27.62 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  27.56 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  33.93 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  41.54 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  38.37 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  41.82 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  26.27 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  30.51 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  42.86 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  35.48 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  38.1 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  28.57 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  31.25 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  33.87 
 
 
233 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  52.86 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1303  general secretion pathway protein I  53.85 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3266  MshA pilin protein MshD  27.27 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  29.36 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>