More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2226 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2226  citrate lyase beta subunit  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1261  putative citrate lyase  95.52 
 
 
290 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3029  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  95.52 
 
 
290 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  51.28 
 
 
286 aa  255  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  44.57 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  37.82 
 
 
269 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.59 
 
 
294 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 
293 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.56 
 
 
274 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  38.43 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.1 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  36.17 
 
 
287 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  35.32 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.97 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  35.59 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 
291 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  38.3 
 
 
277 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  36.03 
 
 
292 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.21 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.21 
 
 
292 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.53 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  36.06 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  36.19 
 
 
302 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  32.32 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  37.45 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  32.62 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 
283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  36.63 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  38.11 
 
 
279 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.27 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35.23 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.53 
 
 
285 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  37.23 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  34.53 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  34.46 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  32.07 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.53 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  33.67 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  36.46 
 
 
297 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  36.56 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  36.56 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  35.88 
 
 
279 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  36.29 
 
 
316 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.22 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  35.23 
 
 
301 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  33.89 
 
 
293 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7154  HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 
291 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.87 
 
 
296 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  34.38 
 
 
306 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
276 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  34.88 
 
 
274 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  33.92 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  35.94 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.58 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.23 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  34.44 
 
 
277 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.58 
 
 
306 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  33.79 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  34.62 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  34.04 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  34.41 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  31.62 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  30.88 
 
 
298 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  32.3 
 
 
290 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.93 
 
 
315 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  36 
 
 
273 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  34.66 
 
 
289 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  33.94 
 
 
274 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  33.94 
 
 
274 aa  116  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  32.41 
 
 
271 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.22 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  32.82 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.81 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.56 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  30.51 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.56 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  30.56 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.56 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  33.61 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  35.14 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.89 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  33.01 
 
 
323 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  35.87 
 
 
276 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  32.51 
 
 
292 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.6 
 
 
289 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  31.23 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 
279 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  30.34 
 
 
292 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1621  HpcH/HpaI aldolase  39.09 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0115166  decreased coverage  0.0000000158082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  34.83 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  32.12 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 
283 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>