270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1996 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  100 
 
 		 190 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  51.14 
 
 		 402 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  52.1 
 
 		 401 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  55.43 
 
 		 273 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  41.21 
 
 		 403 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  38.37 
 
 		 375 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  38.82 
 
 		 356 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  36.42 
 
 		 392 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  34.66 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  34.66 
 
 		 446 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  34.66 
 
 		 430 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 392 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  36.16 
 
 		 433 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  32.82 
 
 		 255 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  34.1 
 
 		 435 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  32.4 
 
 		 411 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  36.42 
 
 		 414 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  36.9 
 
 		 412 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  34.29 
 
 		 426 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  34.29 
 
 		 398 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  34.29 
 
 		 431 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  36.67 
 
 		 391 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 386 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  34.09 
 
 		 428 aa  92  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  37.33 
 
 		 397 aa  91.7  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  32.95 
 
 		 411 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  34.46 
 
 		 411 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  34.46 
 
 		 411 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  31.35 
 
 		 412 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  34.46 
 
 		 411 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  33.99 
 
 		 385 aa  89  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  36.18 
 
 		 407 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 401 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  31.1 
 
 		 407 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  33.33 
 
 		 393 aa  86.3  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  30.64 
 
 		 471 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  31.61 
 
 		 431 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  36.13 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  30.97 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  33.33 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  31.94 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  32.99 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  32.02 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  32.04 
 
 		 385 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.48 
 
 		 390 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  29.41 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.65 
 
 		 392 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  30.95 
 
 		 292 aa  75.1  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.17 
 
 		 305 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  33.54 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  29.65 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.82 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.87 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.91 
 
 		 369 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.65 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.58 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  28.41 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.35 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.37 
 
 		 369 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.37 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.99 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  28.4 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.12 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.15 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.95 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.15 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.61 
 
 		 363 aa  65.1  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.97 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.48 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.15 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.38 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.42 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.11 
 
 		 377 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.78 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  28.77 
 
 		 355 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  27.45 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.14 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25.48 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.28 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  30.71 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.71 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.49 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  27.75 
 
 		 413 aa  58.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.42 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  23.84 
 
 		 356 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 376 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.25 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.82 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  36.49 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.46 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.01 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  29.61 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  29.19 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.86 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>