100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1985 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  91.11 
 
 		 405 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  91.11 
 
 		 405 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  100 
 
 		 405 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  91.11 
 
 		 405 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  35.07 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.98 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  36.01 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  31.87 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  32.29 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  33.75 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.27 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.69 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  30.3 
 
 		 408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  33.7 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  28.46 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  30 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 403 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  25.49 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  22.57 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.54 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  26.3 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.8 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.69 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.69 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.69 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.52 
 
 		 739 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.52 
 
 		 739 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.52 
 
 		 739 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  26.55 
 
 		 755 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  29.25 
 
 		 749 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.3 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.1 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.3 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  24.81 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.91 
 
 		 730 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  28.97 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.19 
 
 		 746 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  24.58 
 
 		 764 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.37 
 
 		 748 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  24.89 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  24.89 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 761 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  33.02 
 
 		 820 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  22.27 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.42 
 
 		 745 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.86 
 
 		 743 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 		 755 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.94 
 
 		 747 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  21.36 
 
 		 328 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  24.6 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.94 
 
 		 746 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  24.27 
 
 		 320 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  25.56 
 
 		 740 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.13 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.2 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  20 
 
 		 753 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  22.17 
 
 		 750 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.08 
 
 		 740 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.39 
 
 		 746 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  24.38 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  26.64 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  24.64 
 
 		 757 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.1 
 
 		 800 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  20.45 
 
 		 324 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.59 
 
 		 744 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  22.13 
 
 		 740 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.01 
 
 		 744 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  22.89 
 
 		 734 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.56 
 
 		 780 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  25.76 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  22.13 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  26.4 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  24.16 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  22.13 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  20.68 
 
 		 726 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  24.23 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  24.31 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  23.48 
 
 		 800 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  24.14 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  25.68 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  24.81 
 
 		 740 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  25.68 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  25.68 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.41 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 		 745 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 		 745 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  20 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  24.91 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  24.34 
 
 		 499 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>