More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1643 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  98.18 
 
 
384 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  98.18 
 
 
384 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  98.44 
 
 
384 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
384 aa  769    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  98.44 
 
 
384 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  98.18 
 
 
384 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  71.54 
 
 
390 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  72.38 
 
 
391 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  69.53 
 
 
383 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  68.31 
 
 
380 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  70.83 
 
 
409 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  65.27 
 
 
383 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  67.01 
 
 
380 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  69.21 
 
 
380 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  69.21 
 
 
380 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  66.67 
 
 
383 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  65.45 
 
 
380 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  67.85 
 
 
380 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  67.57 
 
 
379 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  65.67 
 
 
411 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.39 
 
 
379 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.39 
 
 
379 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.76 
 
 
383 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.39 
 
 
379 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  54.47 
 
 
379 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.39 
 
 
379 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.51 
 
 
383 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.14 
 
 
379 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52 
 
 
381 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.14 
 
 
379 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.66 
 
 
374 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  53.58 
 
 
380 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  53.46 
 
 
380 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.26 
 
 
383 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.88 
 
 
383 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.62 
 
 
381 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50 
 
 
381 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  53.02 
 
 
384 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  47.37 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.79 
 
 
414 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.35 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  49.34 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.5 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
385 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.25 
 
 
409 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.74 
 
 
384 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.25 
 
 
409 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.48 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.82 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.82 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.64 
 
 
383 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.82 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  50 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  49.34 
 
 
384 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.86 
 
 
383 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.33 
 
 
376 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.72 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.94 
 
 
375 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.93 
 
 
394 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  46.02 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  48.79 
 
 
375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  45.65 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  48.79 
 
 
375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  49.19 
 
 
363 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  47.44 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.33 
 
 
375 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.94 
 
 
394 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 
386 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  47.44 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  45.07 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  45.36 
 
 
383 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  47.73 
 
 
377 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.27 
 
 
377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.35 
 
 
385 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.37 
 
 
385 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.43 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  47.86 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.84 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  46.84 
 
 
374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  46.84 
 
 
374 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  45.14 
 
 
382 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.04 
 
 
389 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.84 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.84 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.84 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.84 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.69 
 
 
403 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  46.93 
 
 
362 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.93 
 
 
383 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  46.93 
 
 
362 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>