More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1497 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 
284 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 
285 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 
285 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 
285 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  82.39 
 
 
284 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  81.4 
 
 
285 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  81.4 
 
 
285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  81.05 
 
 
285 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  75.72 
 
 
286 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  75.09 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  73.33 
 
 
294 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  65.19 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  64.68 
 
 
314 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  65.78 
 
 
298 aa  341  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  65.78 
 
 
298 aa  341  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  63.67 
 
 
310 aa  341  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  64.31 
 
 
314 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  66.16 
 
 
297 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  63.24 
 
 
324 aa  338  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  65.38 
 
 
316 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  65.38 
 
 
316 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  65.38 
 
 
316 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  63.6 
 
 
318 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 
316 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 
316 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  65 
 
 
316 aa  334  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 
316 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 
316 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
324 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 
279 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  54.69 
 
 
275 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  54.69 
 
 
275 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
278 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
295 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
285 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
274 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  52.78 
 
 
278 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
268 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
264 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.38 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.65 
 
 
260 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
276 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
267 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.27 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.27 
 
 
260 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
260 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  32.28 
 
 
278 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
267 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 
252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
257 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  33.04 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
268 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 
277 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.89 
 
 
280 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 
259 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
267 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.06 
 
 
278 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 
308 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.69 
 
 
252 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
261 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.84 
 
 
258 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  34.08 
 
 
280 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  29.03 
 
 
254 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
277 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 
252 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 
259 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
267 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
268 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
319 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  31.1 
 
 
262 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  25 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  23.85 
 
 
264 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
294 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  30.71 
 
 
262 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
262 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  27.89 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>