55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1463 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  77.54 
 
 
555 aa  883    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  93.14 
 
 
554 aa  1055    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  79.08 
 
 
555 aa  870    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  78.43 
 
 
557 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  76.99 
 
 
555 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  92.96 
 
 
554 aa  1052    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  78.43 
 
 
557 aa  882    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  93.14 
 
 
554 aa  1057    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  78.43 
 
 
557 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  75.49 
 
 
573 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  74 
 
 
557 aa  842    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1269    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  78.26 
 
 
555 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  93.14 
 
 
554 aa  1055    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  93.14 
 
 
554 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  78 
 
 
564 aa  878    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  91.28 
 
 
669 aa  1086    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  93.14 
 
 
554 aa  1055    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  53.36 
 
 
544 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  52.42 
 
 
558 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  36.5 
 
 
541 aa  313  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  37.57 
 
 
540 aa  308  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  36.52 
 
 
554 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  34.23 
 
 
533 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.84 
 
 
559 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.63 
 
 
568 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  28.14 
 
 
574 aa  87.4  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  25.73 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  27.52 
 
 
579 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  25.14 
 
 
550 aa  67  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.58 
 
 
615 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  23.96 
 
 
606 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  24.85 
 
 
551 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.85 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  22.99 
 
 
617 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  27.11 
 
 
551 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.41 
 
 
607 aa  57.4  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  26.03 
 
 
593 aa  57.4  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.87 
 
 
617 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  24 
 
 
593 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  22.77 
 
 
610 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  33.58 
 
 
324 aa  53.9  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.8 
 
 
612 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  21.88 
 
 
613 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  26.58 
 
 
634 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  29.41 
 
 
619 aa  50.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  28.86 
 
 
619 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.53 
 
 
616 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  30.43 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  25.24 
 
 
625 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  26.43 
 
 
555 aa  47.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  26.45 
 
 
607 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  31.65 
 
 
625 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>