More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1388 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  91.21 
 
 		 550 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  91.21 
 
 		 342 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  89.58 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  91.54 
 
 		 331 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  91.54 
 
 		 331 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  90.15 
 
 		 337 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  89.85 
 
 		 337 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  84.05 
 
 		 600 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  85.05 
 
 		 307 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  83.72 
 
 		 313 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  83.72 
 
 		 313 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  83.72 
 
 		 313 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  84.75 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  85.08 
 
 		 313 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 310 aa  315  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 302 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  51.86 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  51.86 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  48.24 
 
 		 313 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  48.96 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.58 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 546 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  32.28 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  32.28 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  32.28 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  32.28 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.89 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  28.84 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.2 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  31.65 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 537 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.17 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 284 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.11 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  35.19 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.86 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.04 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  35.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.11 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  41.49 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.78 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  24.28 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>