More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1183 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  100 
 
 
677 aa  1313    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  51.01 
 
 
672 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  50.08 
 
 
672 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  50.23 
 
 
672 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  51.1 
 
 
672 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  49.77 
 
 
672 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  51.32 
 
 
672 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.78 
 
 
676 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.19 
 
 
662 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.1 
 
 
668 aa  300  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  35.11 
 
 
681 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.9 
 
 
671 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  32.5 
 
 
686 aa  233  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  31.54 
 
 
695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.01 
 
 
664 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.85 
 
 
684 aa  210  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  25.6 
 
 
678 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  28.94 
 
 
684 aa  207  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  25.28 
 
 
678 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  28.46 
 
 
682 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  28.46 
 
 
682 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  31.05 
 
 
641 aa  170  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.26 
 
 
664 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.44 
 
 
702 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.24 
 
 
664 aa  119  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.19 
 
 
483 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  36.78 
 
 
255 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  32.95 
 
 
255 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  32.95 
 
 
255 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  32.95 
 
 
255 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 
255 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  38.56 
 
 
239 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 
256 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  36.75 
 
 
220 aa  98.2  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  31.84 
 
 
218 aa  98.2  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  32.34 
 
 
255 aa  96.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  35.06 
 
 
254 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.48 
 
 
254 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  36.14 
 
 
220 aa  95.5  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  35.06 
 
 
254 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
205 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 
254 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  94.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  34.39 
 
 
255 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  41.35 
 
 
241 aa  94.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  34.39 
 
 
255 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  34.39 
 
 
255 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  34.39 
 
 
255 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  34.39 
 
 
255 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.77 
 
 
469 aa  93.6  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  37.09 
 
 
173 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  33.51 
 
 
232 aa  93.2  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.94 
 
 
438 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  25.96 
 
 
438 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  36.99 
 
 
176 aa  91.3  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.21 
 
 
438 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  36.5 
 
 
173 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  28.38 
 
 
502 aa  89  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.21 
 
 
256 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  30.64 
 
 
256 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  39.73 
 
 
176 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  41.38 
 
 
176 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  36.99 
 
 
176 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  87.8  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.56 
 
 
457 aa  87  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 
176 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  36.14 
 
 
220 aa  86.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  37.09 
 
 
176 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  37.42 
 
 
176 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.94 
 
 
213 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  40.88 
 
 
173 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  40.88 
 
 
173 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  39.74 
 
 
174 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  39.42 
 
 
173 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  34.51 
 
 
211 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 
224 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 
215 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30.32 
 
 
215 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  38.36 
 
 
176 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.5 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  27.46 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  24.81 
 
 
438 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  28 
 
 
215 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.7 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  32.42 
 
 
221 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 
216 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30.92 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  26.94 
 
 
221 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  28.48 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  39.19 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.92 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  39.19 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  34.91 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  39.19 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>