57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1062 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  95.79 
 
 
1092 aa  2092    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  80.2 
 
 
1100 aa  1833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  40.77 
 
 
1188 aa  801    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  47.91 
 
 
1221 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  43.08 
 
 
1061 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  44.07 
 
 
1067 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  47.79 
 
 
1219 aa  819    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  48.23 
 
 
1816 aa  802    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  100 
 
 
1101 aa  2234    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  54.59 
 
 
1133 aa  1215    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  41.53 
 
 
1194 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  43.4 
 
 
2007 aa  773    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  48.82 
 
 
1341 aa  811    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  55.48 
 
 
1051 aa  1178    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  42.22 
 
 
1057 aa  631  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  32.96 
 
 
1543 aa  504  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  36.71 
 
 
1103 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  40.09 
 
 
3006 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  39.83 
 
 
3238 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  39.94 
 
 
2140 aa  493  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  39.12 
 
 
3286 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  38.53 
 
 
2899 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  38.57 
 
 
3521 aa  476  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  37.83 
 
 
2900 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  32.02 
 
 
1059 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  32.77 
 
 
1159 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  32.6 
 
 
1159 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  31.98 
 
 
1158 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  31.98 
 
 
1158 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  31.03 
 
 
1157 aa  423  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  31.48 
 
 
1157 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  31.84 
 
 
1159 aa  422  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  34.93 
 
 
1137 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  34.55 
 
 
1116 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  31.46 
 
 
1159 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  31.29 
 
 
1157 aa  416  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  34.17 
 
 
1120 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.01 
 
 
1132 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  33.9 
 
 
1120 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  33.98 
 
 
1116 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  34.47 
 
 
1132 aa  406  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  34.47 
 
 
1132 aa  406  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  32.37 
 
 
1012 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  39.64 
 
 
522 aa  336  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  29.97 
 
 
881 aa  274  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  27.51 
 
 
837 aa  206  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  40.07 
 
 
951 aa  195  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  27.57 
 
 
960 aa  194  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  44.02 
 
 
1093 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  44.02 
 
 
1093 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  31.72 
 
 
348 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  42.4 
 
 
1830 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  31.2 
 
 
2400 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  24.13 
 
 
1644 aa  81.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.98 
 
 
918 aa  55.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  26.7 
 
 
1171 aa  52.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1583  hypothetical protein  31.72 
 
 
1329 aa  44.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>