More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0994 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  86.1 
 
 
396 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  88.39 
 
 
360 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  85.61 
 
 
396 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  88.86 
 
 
357 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
462 aa  929    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  87.96 
 
 
355 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  86.83 
 
 
410 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  88.1 
 
 
360 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  85.92 
 
 
357 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  85.92 
 
 
357 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  81.82 
 
 
393 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  89.55 
 
 
356 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  87.5 
 
 
360 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  83.24 
 
 
387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  82.9 
 
 
361 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  79.07 
 
 
360 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  81.9 
 
 
360 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  75 
 
 
350 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  73.02 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 
382 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  42.44 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  44.14 
 
 
328 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  44.2 
 
 
347 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 
331 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
345 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 
337 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 
337 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  38.97 
 
 
332 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  39.12 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 
363 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  39.14 
 
 
326 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
334 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
325 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  36.08 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 
325 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 
332 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
343 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 
338 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
345 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 
336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
336 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 
351 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  34.9 
 
 
331 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 
351 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  35.08 
 
 
332 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
355 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
355 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
332 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
332 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 
325 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
332 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.93 
 
 
334 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
332 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
332 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 
327 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  34.93 
 
 
332 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
334 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
368 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  30.19 
 
 
334 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 
353 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  32.7 
 
 
364 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  30.43 
 
 
371 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
337 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.22 
 
 
337 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  32.13 
 
 
367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  33.65 
 
 
341 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 
367 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  30.19 
 
 
331 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
341 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6285  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
337 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  31.45 
 
 
375 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  33.42 
 
 
388 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  31.78 
 
 
371 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
365 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
365 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
401 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
341 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.11 
 
 
343 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  32.08 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
341 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 
367 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
341 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>