More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0750 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 
360 aa  722    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  90.72 
 
 
420 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  90.72 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  90.42 
 
 
360 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  90.72 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  90.12 
 
 
420 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  90.12 
 
 
420 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  47.31 
 
 
352 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  47.31 
 
 
352 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  45.83 
 
 
359 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  47.03 
 
 
352 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  49.13 
 
 
352 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  48.84 
 
 
352 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  44.13 
 
 
352 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  45.81 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  44.54 
 
 
357 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.34 
 
 
357 aa  199  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  37.29 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.99 
 
 
355 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  35.8 
 
 
346 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  35.59 
 
 
351 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.61 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  36.31 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.65 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.65 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.94 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  35.75 
 
 
349 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.38 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  34.94 
 
 
354 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.99 
 
 
357 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.12 
 
 
379 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.57 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.72 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.44 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.79 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  33.43 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.53 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  33.98 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  33.98 
 
 
390 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  33.82 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  33.82 
 
 
355 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.33 
 
 
354 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  34.37 
 
 
352 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  34.37 
 
 
352 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  34.37 
 
 
352 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  34.37 
 
 
352 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.36 
 
 
354 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  33.05 
 
 
355 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.26 
 
 
353 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  34.37 
 
 
352 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.57 
 
 
377 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.62 
 
 
351 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
377 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.69 
 
 
361 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.99 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.97 
 
 
374 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.51 
 
 
403 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.71 
 
 
363 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.51 
 
 
390 aa  166  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.36 
 
 
366 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.43 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.19 
 
 
392 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.11 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  32.46 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.49 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.6 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
383 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.94 
 
 
354 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.33 
 
 
398 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.75 
 
 
377 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  36.22 
 
 
377 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0762  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.53 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.7 
 
 
383 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 
384 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.87 
 
 
383 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  28.45 
 
 
373 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.87 
 
 
383 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.87 
 
 
383 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
353 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.37 
 
 
363 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.87 
 
 
383 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
353 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.21 
 
 
360 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
378 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.2 
 
 
377 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.83 
 
 
376 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.1 
 
 
377 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.96 
 
 
387 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.87 
 
 
383 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.74 
 
 
378 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.59 
 
 
353 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 
377 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.3 
 
 
390 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.99 
 
 
383 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.17 
 
 
373 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.1 
 
 
352 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>