More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0623 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  100 
 
 
356 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  37.26 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  35.53 
 
 
402 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  35.45 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  33.51 
 
 
396 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  34.78 
 
 
403 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  35.16 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.44 
 
 
411 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.44 
 
 
411 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.99 
 
 
428 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.44 
 
 
411 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  26.97 
 
 
433 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  26.62 
 
 
446 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2522  Bbp50  89.06 
 
 
64 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  26.62 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  26.37 
 
 
430 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.55 
 
 
431 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  24.29 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.83 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  26.64 
 
 
398 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  26.61 
 
 
411 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  26.59 
 
 
411 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.35 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  28.35 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.51 
 
 
390 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  29.62 
 
 
255 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  32.47 
 
 
435 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.76 
 
 
297 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  28.76 
 
 
297 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  35.74 
 
 
273 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  28.09 
 
 
388 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  38.82 
 
 
190 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.4 
 
 
381 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.55 
 
 
401 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.54 
 
 
369 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  27.27 
 
 
341 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  90.2 
 
 
69 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.15 
 
 
412 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.91 
 
 
392 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.79 
 
 
391 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  28.68 
 
 
359 aa  100  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  28.76 
 
 
293 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.28 
 
 
471 aa  99.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.35 
 
 
392 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  23.95 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  32.8 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  25.64 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.22 
 
 
386 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  27.36 
 
 
407 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.4 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.32 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.74 
 
 
414 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  32.05 
 
 
292 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  25 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.58 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  43.09 
 
 
139 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.36 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.3 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  27.22 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  25.73 
 
 
417 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.79 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.28 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.8 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  29.41 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.94 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.93 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  31.52 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.83 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.27 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  28.12 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  24.11 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.11 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.51 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  28.3 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  27.02 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  30.3 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.3 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.42 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.89 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.68 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.55 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.57 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  28.8 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  28.7 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.58 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.32 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.66 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  28.19 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.1 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.15 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.09 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.09 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.09 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.6 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.6 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.18 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.08 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  29.69 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>