More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0513 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
387 aa  768  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  88.71 
 
 
374 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  87.88 
 
 
369 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  87.88 
 
 
369 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  88.6 
 
 
346 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  88.6 
 
 
346 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  88.6 
 
 
346 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  88.79 
 
 
343 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  68.77 
 
 
327 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  65.98 
 
 
334 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  67.91 
 
 
324 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  67.91 
 
 
324 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.4 
 
 
338 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  67.6 
 
 
324 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  68.34 
 
 
322 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  65.99 
 
 
338 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  66.77 
 
 
322 aa  415  1e-115  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  65.4 
 
 
338 aa  406  1e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  67.09 
 
 
322 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  63.93 
 
 
327 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  68.03 
 
 
321 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  55.69 
 
 
327 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  55.84 
 
 
321 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  55.84 
 
 
321 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  55.84 
 
 
321 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  55.84 
 
 
321 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  55.84 
 
 
321 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  55.84 
 
 
321 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  52.11 
 
 
335 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 
320 aa  307  2e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  46.08 
 
 
320 aa  305  8e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  50.45 
 
 
338 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  48.91 
 
 
325 aa  289  5e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  51.42 
 
 
317 aa  283  4e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  47.34 
 
 
336 aa  282  8e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  48.88 
 
 
363 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  49.39 
 
 
339 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  48.05 
 
 
334 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  45.29 
 
 
354 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  49.38 
 
 
324 aa  273  5e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 
311 aa  273  5e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  49.69 
 
 
334 aa  273  5e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 
311 aa  273  5e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 
362 aa  272  8e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  62.26 
 
 
215 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  53.4 
 
 
323 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  48.87 
 
 
312 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  49.03 
 
 
338 aa  270  3e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 
336 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  46.23 
 
 
319 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  48.9 
 
 
336 aa  266  3e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  47.09 
 
 
341 aa  267  3e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  49.06 
 
 
327 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  47.06 
 
 
345 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 
344 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 
344 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  56.59 
 
 
437 aa  266  6e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  45.58 
 
 
375 aa  266  6e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  47.34 
 
 
320 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  48.18 
 
 
351 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  47.81 
 
 
328 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 
344 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
344 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 
344 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 
344 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 
312 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 
344 aa  262  7e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  50.48 
 
 
310 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  43.49 
 
 
342 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  48.77 
 
 
328 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 
321 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  45.14 
 
 
331 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 
321 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  46.56 
 
 
321 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.3 
 
 
349 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
315 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  46.61 
 
 
346 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  47.25 
 
 
357 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  47.55 
 
 
334 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
329 aa  255  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  47.08 
 
 
338 aa  255  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 
332 aa  254  1e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 
338 aa  254  2e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  47.55 
 
 
334 aa  254  2e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 
341 aa  253  4e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 
330 aa  252  9e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
345 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
322 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  50.94 
 
 
320 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  46.81 
 
 
331 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  41.23 
 
 
358 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  47.73 
 
 
312 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  45.23 
 
 
327 aa  246  5e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  46.11 
 
 
321 aa  245  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 
325 aa  244  2e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  47.89 
 
 
333 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
317 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  48.58 
 
 
330 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  45.62 
 
 
341 aa  240  3e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  47.95 
 
 
319 aa  240  3e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>