More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0215 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
382 aa  785  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  73.51 
 
 
386 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  58.89 
 
 
384 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  57.37 
 
 
391 aa  446  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  56.69 
 
 
389 aa  438  1e-122  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  56.69 
 
 
389 aa  438  1e-122  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  56.43 
 
 
389 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  56.13 
 
 
382 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  56.13 
 
 
382 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  53.39 
 
 
381 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  49.48 
 
 
383 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.41 
 
 
414 aa  357  2e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  50.66 
 
 
380 aa  357  2e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.95 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  51.5 
 
 
384 aa  356  4e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  48.86 
 
 
394 aa  353  3e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  49.37 
 
 
396 aa  353  3e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  50.55 
 
 
384 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  50.55 
 
 
384 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  50.55 
 
 
384 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  50.55 
 
 
384 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  47.66 
 
 
383 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  50 
 
 
384 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.73 
 
 
384 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2222  hypothetical protein  83.17 
 
 
209 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1247  hypothetical protein  83.17 
 
 
209 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.127148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1943  hypothetical protein  83.17 
 
 
209 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366238  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  48.1 
 
 
394 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0960  hypothetical protein  83.17 
 
 
209 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0293  outer membrane porin OpcP  82.69 
 
 
209 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  47.14 
 
 
383 aa  340  3e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  50.41 
 
 
385 aa  339  6e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  47.81 
 
 
383 aa  338  1e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1660  hypothetical protein  81.25 
 
 
209 aa  337  2e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  49.32 
 
 
386 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  47.86 
 
 
382 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  49.17 
 
 
386 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  46.05 
 
 
381 aa  319  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.68 
 
 
379 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.27 
 
 
376 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  44.7 
 
 
379 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  44.96 
 
 
379 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  44.7 
 
 
379 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  44.7 
 
 
379 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  44.44 
 
 
379 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.55 
 
 
381 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.48 
 
 
383 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.22 
 
 
383 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.17 
 
 
381 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  44.06 
 
 
374 aa  289  5e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.7 
 
 
381 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.67 
 
 
379 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.8 
 
 
381 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.41 
 
 
377 aa  283  5e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.47 
 
 
384 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.35 
 
 
375 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  43.73 
 
 
383 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.64 
 
 
379 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.97 
 
 
384 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.97 
 
 
384 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.97 
 
 
384 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  41.98 
 
 
389 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  43.97 
 
 
384 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  43.97 
 
 
384 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.72 
 
 
384 aa  274  2e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  42.93 
 
 
383 aa  274  2e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.57 
 
 
380 aa  273  2e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.74 
 
 
375 aa  274  2e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  43.69 
 
 
391 aa  272  8e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.19 
 
 
380 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  43.43 
 
 
409 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  43.43 
 
 
409 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.6 
 
 
383 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  43.48 
 
 
380 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.49722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.73 
 
 
390 aa  269  6e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  38.85 
 
 
385 aa  269  6e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  43.1 
 
 
403 aa  269  6e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.47 
 
 
375 aa  269  6e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.47 
 
 
375 aa  269  6e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.75 
 
 
385 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.01 
 
 
379 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.5 
 
 
385 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  42.56 
 
 
384 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.18 
 
 
436 aa  267  3e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  42.25 
 
 
418 aa  266  6e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.94 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.94 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.94 
 
 
436 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.94 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.94 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.94 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  41.5 
 
 
418 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  43.04 
 
 
471 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.19 
 
 
380 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>