More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3232 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  83.54 
 
 
409 aa  692  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  83.54 
 
 
409 aa  692  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
409 aa  836  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  83.78 
 
 
414 aa  695  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  72.97 
 
 
410 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  59.55 
 
 
399 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  57.14 
 
 
404 aa  447  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  52.66 
 
 
392 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3184e-11 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  46.53 
 
 
440 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  44.76 
 
 
410 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  39.75 
 
 
403 aa  292  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  38.65 
 
 
418 aa  269  6e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  39.95 
 
 
400 aa  260  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  36.93 
 
 
418 aa  259  5e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  36.93 
 
 
418 aa  259  5e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  37.09 
 
 
418 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  38.32 
 
 
395 aa  254  2e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  37.06 
 
 
418 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 
402 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  37.72 
 
 
402 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  37.44 
 
 
418 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  38.23 
 
 
399 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  38.23 
 
 
398 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  38.07 
 
 
400 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  7.70896e-14  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  38.6 
 
 
395 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  39.22 
 
 
389 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  36.84 
 
 
418 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  38.03 
 
 
394 aa  244  2e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  37.63 
 
 
418 aa  243  4e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  35.27 
 
 
455 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  35.49 
 
 
446 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  36.59 
 
 
418 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  36.74 
 
 
434 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  36.55 
 
 
415 aa  234  2e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  37.84 
 
 
418 aa  233  7e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  36.3 
 
 
418 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  34.6 
 
 
426 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  35.53 
 
 
417 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  36.59 
 
 
445 aa  229  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  37.04 
 
 
418 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  36.07 
 
 
404 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.27 
 
 
421 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  33.58 
 
 
404 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  35.51 
 
 
390 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  33 
 
 
404 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  32.83 
 
 
404 aa  223  5e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  32.75 
 
 
404 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.58 
 
 
404 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.58 
 
 
404 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.58 
 
 
404 aa  222  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  34.79 
 
 
410 aa  221  2e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  32.9 
 
 
394 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  36.12 
 
 
402 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  33.88 
 
 
429 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  33.33 
 
 
395 aa  219  9e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  32.84 
 
 
406 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  35.68 
 
 
414 aa  216  6e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  35 
 
 
404 aa  213  3e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.51 
 
 
402 aa  213  4e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  32.23 
 
 
416 aa  213  6e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  34.28 
 
 
396 aa  213  6e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  34.19 
 
 
396 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  33.49 
 
 
428 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  33.67 
 
 
397 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.28 
 
 
394 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.87 
 
 
404 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  33.59 
 
 
403 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.02 
 
 
394 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  33.5 
 
 
416 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.81 
 
 
408 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  32.32 
 
 
409 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  32.3 
 
 
395 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  8.24162e-07 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  33.33 
 
 
404 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  35.55 
 
 
401 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  33 
 
 
409 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.75 
 
 
401 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  33 
 
 
413 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  32.07 
 
 
414 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  32.59 
 
 
398 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  35.15 
 
 
466 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.25 
 
 
396 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  35.16 
 
 
462 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  34.2 
 
 
387 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  32.41 
 
 
417 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  34.41 
 
 
395 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  32.31 
 
 
394 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.59 
 
 
402 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  33.25 
 
 
413 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  32.31 
 
 
394 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  29.87 
 
 
410 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  33.59 
 
 
397 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  30.12 
 
 
410 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  32.74 
 
 
391 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  34 
 
 
400 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  32.37 
 
 
419 aa  203  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  35.64 
 
 
420 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  31.11 
 
 
413 aa  201  1e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  32.55 
 
 
409 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  35.28 
 
 
439 aa  201  2e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  34.61 
 
 
409 aa  201  2e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>