162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3008 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 
377 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  94.69 
 
 
377 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  94.16 
 
 
377 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  94.43 
 
 
377 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  94.43 
 
 
377 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  94.43 
 
 
377 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  94.43 
 
 
377 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  94.43 
 
 
377 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  78.61 
 
 
376 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  78.19 
 
 
386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  81.13 
 
 
378 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  81.13 
 
 
378 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  81.4 
 
 
378 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  78.34 
 
 
376 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  80.59 
 
 
378 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  79.51 
 
 
378 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  80.86 
 
 
378 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  81.13 
 
 
378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  59.84 
 
 
379 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  59.19 
 
 
381 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  59.19 
 
 
381 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 
402 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  59.89 
 
 
410 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 
378 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  47.49 
 
 
365 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
374 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
372 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  55.09 
 
 
363 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  51.6 
 
 
398 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  49.71 
 
 
358 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  40.6 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  40.6 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  45.98 
 
 
355 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.9 
 
 
394 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
350 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  42.77 
 
 
368 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  43.94 
 
 
338 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  43.99 
 
 
369 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  44.93 
 
 
353 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  43.57 
 
 
346 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  37.14 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  40.24 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  40.24 
 
 
356 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
354 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  43.6 
 
 
338 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  43.64 
 
 
338 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 
338 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 
353 aa  230  3e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  40.67 
 
 
334 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  41.43 
 
 
334 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  41.43 
 
 
334 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  42.36 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
325 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
367 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  39.39 
 
 
316 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  38.3 
 
 
325 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  40.12 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  40.12 
 
 
339 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  39.43 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  38.58 
 
 
337 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  37.5 
 
 
324 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  39.27 
 
 
338 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.93 
 
 
316 aa  192  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  35.87 
 
 
330 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  33.79 
 
 
392 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  32.1 
 
 
342 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  34.3 
 
 
338 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  34.13 
 
 
340 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 
374 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.1 
 
 
375 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  34.02 
 
 
338 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  34.02 
 
 
338 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  34.02 
 
 
338 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.64 
 
 
382 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  30.7 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.06 
 
 
385 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  31.45 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  28.94 
 
 
388 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  32.66 
 
 
398 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  30.89 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  28.37 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  29.19 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  32.59 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  28.27 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  27.05 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  26.86 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.81 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>