More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2371 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  77.78 
 
 
264 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  85.71 
 
 
266 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  85.71 
 
 
266 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  85.71 
 
 
266 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  78.16 
 
 
264 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  78.16 
 
 
264 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  85.71 
 
 
266 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  78.16 
 
 
264 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  85.71 
 
 
266 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  85.34 
 
 
266 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  84.96 
 
 
266 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  77.69 
 
 
264 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  76.54 
 
 
264 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  78.54 
 
 
264 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  53.46 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  49.81 
 
 
275 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  47.98 
 
 
268 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  46.37 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
266 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  48.03 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  48.03 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  52.51 
 
 
273 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  52.14 
 
 
273 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
275 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  47.66 
 
 
268 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 
272 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  44 
 
 
274 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  42.21 
 
 
286 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 
279 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  35.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
278 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  37.02 
 
 
277 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
278 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
278 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
278 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 
271 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  34.12 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.47 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.77 
 
 
278 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.6 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 
355 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 
281 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
281 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
279 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
282 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 
273 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
276 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.1 
 
 
284 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 
278 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
278 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.84 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  35 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 
278 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 
280 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 
269 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
280 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
280 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
274 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
280 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
276 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 
278 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  35.41 
 
 
278 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
281 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
281 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
273 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.63 
 
 
273 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 
278 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  31.73 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>