66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2308 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  83.7 
 
 
365 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  98.36 
 
 
366 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  98.09 
 
 
366 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  91.53 
 
 
366 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  91.26 
 
 
366 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  91.26 
 
 
366 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  91.53 
 
 
366 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  91.53 
 
 
366 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  91.26 
 
 
366 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  753    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  98.09 
 
 
366 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  91.26 
 
 
366 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  98.36 
 
 
366 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  83.15 
 
 
365 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  83.33 
 
 
365 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  55.21 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  54.8 
 
 
367 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  56.5 
 
 
379 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  54.24 
 
 
367 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  51.25 
 
 
373 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  52.12 
 
 
367 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  51.82 
 
 
392 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  54.08 
 
 
385 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  51.92 
 
 
393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 
380 aa  352  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51.28 
 
 
367 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  51.56 
 
 
389 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  52.12 
 
 
389 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  49 
 
 
376 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  49.47 
 
 
397 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  44.6 
 
 
379 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  45.15 
 
 
376 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 
385 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  45.68 
 
 
362 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  45.68 
 
 
362 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 
360 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.01 
 
 
360 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  40 
 
 
354 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  42.25 
 
 
354 aa  285  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.49 
 
 
392 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  31.87 
 
 
385 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.92 
 
 
413 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  27.6 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  29.17 
 
 
348 aa  113  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  30.43 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  30.52 
 
 
347 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  31.23 
 
 
346 aa  102  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.55 
 
 
398 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  24.74 
 
 
380 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.2 
 
 
748 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  21.16 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  33.91 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  33.91 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  33.04 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  40.58 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  33.04 
 
 
282 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  20.69 
 
 
450 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 
222 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  51.22 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
217 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 
222 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  44.83 
 
 
233 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>