More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2298 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  100 
 
 
325 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  90.46 
 
 
325 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  90.15 
 
 
325 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  90.46 
 
 
325 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  80.37 
 
 
321 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  80.37 
 
 
321 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  80.82 
 
 
321 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  80.37 
 
 
321 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  81.13 
 
 
321 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  75.7 
 
 
324 aa  484  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  80.37 
 
 
321 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  80.37 
 
 
321 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  74.69 
 
 
322 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  72.1 
 
 
321 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  74.84 
 
 
324 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  71.92 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  59.38 
 
 
321 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  58.2 
 
 
326 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  60.5 
 
 
329 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  57.89 
 
 
326 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  58.2 
 
 
326 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  57.45 
 
 
324 aa  361  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  57.45 
 
 
324 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  57.45 
 
 
324 aa  360  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  57.45 
 
 
324 aa  360  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  57.45 
 
 
324 aa  360  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  57.45 
 
 
324 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  57.45 
 
 
324 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  56 
 
 
325 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  57.45 
 
 
324 aa  358  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  57.14 
 
 
324 aa  358  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3376  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  60.82 
 
 
320 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.555118  normal  0.118844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  56.13 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  57.99 
 
 
324 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3708  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  52.31 
 
 
327 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.971324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  59.49 
 
 
328 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2382  gluconate 2-dehydrogenase  59.87 
 
 
320 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54026  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  57.99 
 
 
324 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  61.13 
 
 
321 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  57.99 
 
 
324 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2568  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  59.56 
 
 
320 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217021  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  58.54 
 
 
328 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  57.68 
 
 
324 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  55.94 
 
 
320 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  57.68 
 
 
324 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  55.62 
 
 
320 aa  345  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  55.45 
 
 
321 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2904  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  57.05 
 
 
322 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.44 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  59.49 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  56.99 
 
 
324 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  53.33 
 
 
324 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  51.54 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  53.37 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  52.45 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30550  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  53.7 
 
 
326 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3413  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.85 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1485  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  53.5 
 
 
332 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.11 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1736  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  52.7 
 
 
335 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1261  2-hydroxyacid dehydrogenase  49.84 
 
 
324 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829817  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.52 
 
 
324 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2000  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.56 
 
 
318 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.4 
 
 
337 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4585  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.89 
 
 
324 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177962  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  47.65 
 
 
327 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.8 
 
 
330 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  55.12 
 
 
341 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  48.62 
 
 
324 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  50.7 
 
 
320 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
320 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  47.17 
 
 
330 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  47.17 
 
 
330 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.17 
 
 
330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  44 
 
 
334 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.86 
 
 
330 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.86 
 
 
330 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.23 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  51.38 
 
 
327 aa  261  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  52.4 
 
 
340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2771  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.87 
 
 
321 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.05 
 
 
328 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.28 
 
 
331 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  49.3 
 
 
319 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  46.91 
 
 
348 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.39 
 
 
323 aa  248  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.3 
 
 
326 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.15 
 
 
329 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  42.99 
 
 
339 aa  246  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  41.88 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.88 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.56 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  47.88 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.97 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  47.88 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  47.88 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  44.85 
 
 
329 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.56 
 
 
352 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>