139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2167 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  98.08 
 
 
156 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  98.08 
 
 
156 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  98.08 
 
 
156 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  84.62 
 
 
156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  83.97 
 
 
156 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  83.97 
 
 
156 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  83.33 
 
 
156 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  83.97 
 
 
156 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  83.97 
 
 
156 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  80.77 
 
 
156 aa  253  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  51.81 
 
 
185 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  52.6 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  54.9 
 
 
153 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  50.31 
 
 
162 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  51.57 
 
 
162 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  48.19 
 
 
166 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  49.38 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  45.78 
 
 
167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  49.37 
 
 
158 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  47.9 
 
 
195 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  46.5 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  43.71 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  39.16 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 
160 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.94 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  42.58 
 
 
146 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  47.4 
 
 
154 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  36.69 
 
 
168 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  42.31 
 
 
150 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  36.69 
 
 
168 aa  103  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  41.03 
 
 
146 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  41.03 
 
 
146 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  39.61 
 
 
145 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  39.61 
 
 
145 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  42.68 
 
 
157 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  38.27 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  38.75 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  38.75 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  38.75 
 
 
149 aa  94  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
149 aa  94  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  38.75 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  37.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  37.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  37.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  37.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  37.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  56 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 
451 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 
503 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 
439 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
511 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
511 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
552 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 
404 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  40 
 
 
405 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 
404 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
428 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
352 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 
546 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 
546 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  46.81 
 
 
531 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  42 
 
 
663 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 
242 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  54.55 
 
 
1051 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 
361 aa  50.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
382 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
339 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
322 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  48.98 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  42.55 
 
 
440 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 
651 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
440 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
334 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
572 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.4 
 
 
470 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 
1910 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0628  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 
302 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 
367 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  48.98 
 
 
638 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 
676 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 
680 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  39.62 
 
 
425 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
309 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  43.4 
 
 
663 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  39.29 
 
 
243 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 
1086 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  30.11 
 
 
318 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>